272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0008 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0008  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0029  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.304599 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0007  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0060  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.864941  normal  0.898441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0009  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.702831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6004  tRNA-Arg  90.67 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0066  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.171209  normal  0.834586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0014  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.434333 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0045  tRNA-Arg  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0288  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528519  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0006  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t05  tRNA-Arg  90.62 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0015  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0011  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0067  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0009  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0001  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0058  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0054    91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0001  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0013  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.249758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0001  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.336526  hitchhiker  0.00896286 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0006  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0010  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.312192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0001  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.286753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0068  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.754645  normal  0.377618 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0064  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294983  normal  0.0656653 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0303  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4595  tRNA-Arg  90.32 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.372122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0056  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.159336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0062  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0004  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0004  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000567869 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0030  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000476466  normal  0.507447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0036  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0602741  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_003295  RS01507  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000147856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0030  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0031  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292671  normal  0.864836 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2945  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0156149  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0028  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.110227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1960  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158848  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0043  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0076  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00038438  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4320  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.438611  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0036  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000227912  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0037  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000021714  normal  0.246057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0038  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000220683  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0032  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121216  normal  0.785903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0044  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0028  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00103992  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0029  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00109449  normal  0.51543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0062  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0063  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3012  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0009  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0136864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0081  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0141805 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0030  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0479524  normal  0.8526 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0026  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0422227  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0011  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0012  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00501497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0013  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3011  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.437147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0043  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0029  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1961  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2946  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0044  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709803  normal  0.0256075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0003  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2652  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122696  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2651  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00638973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0818  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0819  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0029  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.320042  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0030  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.324137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000374311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0009  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000206186  hitchhiker  0.00000000390519 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0049  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0051  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0034  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00579174  normal  0.03113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>