298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_R0043 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000141342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0006  tRNA-Arg  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000140525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0027  tRNA-Arg  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna10  tRNA-Arg  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0050  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.557723  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0050  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00323703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0029  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0001  tRNA-Arg  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.696589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0024  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0903  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0055  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000119585  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0056  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000106381  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1260  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.285329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0021  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  0.330692 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1005  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0045  tRNA-Arg  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739134 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1317  tRNA-Arg  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0566482  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0088  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.56142e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0025  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0024  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0114  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00529639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0115  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000730422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0116  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000643012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0049  tRNA-Arg  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000230813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0053  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0004  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000109106  hitchhiker  0.000000979615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0038  tRNA-Arg  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0062  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0049  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000321594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0113  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196307  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t088  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0081  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000923685  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0059  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000542339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0079  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000061602  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0052  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000305181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0083  tRNA-Arg  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000215013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0110  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607577  hitchhiker  0.0000634029 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0082  tRNA-Arg  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302683  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0080  tRNA-Arg  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000233743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0077  tRNA-Arg  95 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000716248  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0034  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0228337  hitchhiker  0.00733773 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0040  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409626  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0055  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000268811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0042  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.046483  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0051  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000808669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0050  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000319175  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  0.0000613432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1045  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1047  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03501  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03503  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03499  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03504  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>