34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2991 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2991  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  620  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4704  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.32 
 
 		 309 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5466  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.32 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5396  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.32 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.003099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.1 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4874  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.88 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6029  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.62 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305339  normal  0.119752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0714  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.49 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.958974 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.8 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4098  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.86 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.52814  normal  0.192978 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3985  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.86 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0969  gluconolactonase  26.03 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.11 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  27.41 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4512  gluconolactonase  27.2 
 
 		 305 aa  52.8  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00932463  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3880  hypothetical protein  32.35 
 
 		 320 aa  52.4  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0133982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4136  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.03 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.74 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  28.37 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2769  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.2 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0137124  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2712  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.2 
 
 		 324 aa  51.2  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.290527  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4154  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.16 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.83646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4042  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.16 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3570  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.83 
 
 		 268 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal  0.131485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.55 
 
 		 279 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.54 
 
 		 930 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0906  gluconolactonase  26.18 
 
 		 299 aa  46.2  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.54 
 
 		 522 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2153  gluconolactonase  28.04 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.669846 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2315  drp35 protein  22.22 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.81 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4886  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.71 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.889776  normal  0.201876 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0852  gluconolactonase  23.97 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.326327 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0305  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.48 
 
 		 319 aa  43.9  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>