41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4170 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  82.02 
 
 		 308 aa  454  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  73.4 
 
 		 309 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  26.67 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  27.56 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  32.18 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  31.68 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  31.19 
 
 		 302 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  26.21 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  25.4 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  25.3 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  26.42 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  27.14 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  27.78 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  26.67 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  28.65 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  28.65 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  28.65 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  27.32 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  28.7 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  24.35 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  28.92 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  27.65 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  24.23 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  28.5 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  29.13 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  28.5 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  28.5 
 
 		 335 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  26.53 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  24.46 
 
 		 333 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  25.13 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  28.31 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  33.63 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  28.68 
 
 		 269 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  25.57 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  27.16 
 
 		 275 aa  47  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  25.99 
 
 		 275 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  25.99 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  25.99 
 
 		 275 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  30.16 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0064  hypothetical protein  24.88 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>