46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3535 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 		 329 aa  686    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  73.78 
 
 		 330 aa  510  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  78.86 
 
 		 334 aa  507  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  64.65 
 
 		 331 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  63.24 
 
 		 324 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  62.89 
 
 		 335 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  62.89 
 
 		 335 aa  428  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  62.58 
 
 		 335 aa  427  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  58.05 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  58.05 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  62.03 
 
 		 338 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  58.05 
 
 		 331 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  58.21 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  55.82 
 
 		 335 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  62.25 
 
 		 333 aa  400  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  60.47 
 
 		 321 aa  381  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  56.19 
 
 		 329 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  56.27 
 
 		 307 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  57.95 
 
 		 311 aa  360  1e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  57.28 
 
 		 311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  56.29 
 
 		 310 aa  350  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  51.84 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  53.58 
 
 		 318 aa  338  7e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  54.33 
 
 		 316 aa  334  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  35.98 
 
 		 275 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  35.74 
 
 		 275 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  35.74 
 
 		 275 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  38.52 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  34.22 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  32.45 
 
 		 275 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  33.7 
 
 		 302 aa  155  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  32.51 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  32.16 
 
 		 302 aa  152  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  35.08 
 
 		 289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  33.67 
 
 		 276 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  27.18 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  26.96 
 
 		 326 aa  89  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  26.01 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  24.84 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  24.69 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  25.39 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  23.33 
 
 		 333 aa  75.9  0.0000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  23.08 
 
 		 364 aa  69.7  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  25.12 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  24.6 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  24.23 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>