46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4144 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 
333 aa  677    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  61.92 
 
 
329 aa  422  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  57.06 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  58.54 
 
 
331 aa  395  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  59.06 
 
 
334 aa  386  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  56.92 
 
 
335 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  56.92 
 
 
335 aa  382  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  56.6 
 
 
335 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  55.52 
 
 
331 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  54.68 
 
 
335 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  55.52 
 
 
331 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  55.52 
 
 
331 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  52.87 
 
 
335 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  54.84 
 
 
324 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  52.35 
 
 
338 aa  359  4e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  55.92 
 
 
321 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  54.79 
 
 
307 aa  340  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  55.23 
 
 
329 aa  338  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  56.04 
 
 
311 aa  333  2e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  52.87 
 
 
312 aa  331  9e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  55.18 
 
 
311 aa  326  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  55.33 
 
 
316 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  55.03 
 
 
318 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  53.9 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  36.36 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  36.11 
 
 
275 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  36.11 
 
 
275 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  34.92 
 
 
275 aa  165  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  34.88 
 
 
275 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  35.12 
 
 
275 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  33.45 
 
 
302 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  32.97 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  32.62 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  32.99 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  46.36 
 
 
276 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.73 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  27.72 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  25.82 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  26.45 
 
 
329 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  25.08 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  25 
 
 
333 aa  87.8  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  22.84 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  27.32 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  24.19 
 
 
309 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  24.46 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  22.45 
 
 
364 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>