46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1946 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 		 324 aa  669    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  61.7 
 
 		 330 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  63.24 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  65.65 
 
 		 334 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  60.63 
 
 		 331 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  55.29 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  56.7 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  56.7 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  56.7 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  54.38 
 
 		 335 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  55.52 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  55.52 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  55.52 
 
 		 331 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  56.87 
 
 		 338 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  57.58 
 
 		 307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  60 
 
 		 321 aa  360  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  55.07 
 
 		 333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  53.04 
 
 		 329 aa  355  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  55.1 
 
 		 310 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  53.36 
 
 		 311 aa  330  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  53.36 
 
 		 311 aa  328  8e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  53.36 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  52.22 
 
 		 318 aa  323  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  48.71 
 
 		 312 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  38.82 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  38.58 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  38.58 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  37.11 
 
 		 275 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  34.69 
 
 		 275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  35.32 
 
 		 275 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  30.53 
 
 		 289 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  31.27 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  30.63 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  30.91 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  31.42 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.69 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  24.05 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  26.6 
 
 		 329 aa  82.4  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  23.49 
 
 		 333 aa  80.5  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  25.17 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  22.93 
 
 		 329 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  23.83 
 
 		 325 aa  73.2  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  27.32 
 
 		 312 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  26.76 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  24.48 
 
 		 364 aa  57.4  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  23.68 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>