46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3578 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 
316 aa  649    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  69.52 
 
 
310 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  66.32 
 
 
311 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  66.21 
 
 
311 aa  420  1e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  62.5 
 
 
329 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  62.63 
 
 
321 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  60.07 
 
 
307 aa  355  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  54.94 
 
 
330 aa  354  7.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  53.8 
 
 
335 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  53.8 
 
 
335 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  53.48 
 
 
335 aa  346  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  54.49 
 
 
331 aa  345  6e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  56.38 
 
 
318 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  53.04 
 
 
331 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  53.04 
 
 
331 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  53.04 
 
 
331 aa  343  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  54.69 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  53.67 
 
 
329 aa  340  1e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  50.8 
 
 
338 aa  335  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  51.27 
 
 
335 aa  334  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  52.72 
 
 
324 aa  334  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  50.96 
 
 
335 aa  332  6e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  54.61 
 
 
334 aa  329  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  55.33 
 
 
333 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  38.25 
 
 
275 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  38.25 
 
 
275 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  37.85 
 
 
275 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  36 
 
 
275 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  37.45 
 
 
275 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  35.6 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  29.93 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  29.25 
 
 
302 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  28.91 
 
 
310 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  31.82 
 
 
289 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.23 
 
 
326 aa  123  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  26.67 
 
 
330 aa  112  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  27.8 
 
 
329 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  31.03 
 
 
325 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  27.87 
 
 
333 aa  107  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  26.3 
 
 
308 aa  104  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  29.25 
 
 
276 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.47 
 
 
329 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  27.84 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  28.79 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  25.71 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  21.92 
 
 
364 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>