46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6505 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 		 318 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  76.39 
 
 		 312 aa  491  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  58.69 
 
 		 307 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  59.34 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  61.59 
 
 		 321 aa  362  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  58.25 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  53.58 
 
 		 329 aa  347  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  58.28 
 
 		 311 aa  345  4e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  57.73 
 
 		 316 aa  343  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  57.24 
 
 		 310 aa  341  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  50.76 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  52.22 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  51.75 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  51.75 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  51.42 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  51.59 
 
 		 335 aa  325  6e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  53.77 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  50.8 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  50.8 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  50.8 
 
 		 331 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  55.22 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  48.91 
 
 		 335 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  49.36 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  50.62 
 
 		 331 aa  309  4e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  37.93 
 
 		 275 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  36.6 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  38.98 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  37.45 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  37.45 
 
 		 275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  34.85 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  34.03 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  34.03 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  35.36 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  31.49 
 
 		 289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  27.97 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  27.78 
 
 		 326 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  27.36 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  28.86 
 
 		 329 aa  94  3e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  24.28 
 
 		 330 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  31.18 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  26.2 
 
 		 325 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  26.33 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  30.04 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  27.56 
 
 		 312 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  27.1 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  22.31 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>