40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1664 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 
289 aa  580  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  44.81 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  37.01 
 
 
330 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  36.97 
 
 
275 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  36.71 
 
 
275 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  36.84 
 
 
331 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  36.97 
 
 
275 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  36.97 
 
 
275 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  36.92 
 
 
321 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  36.71 
 
 
275 aa  152  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  35.66 
 
 
331 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  35.66 
 
 
331 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  35.66 
 
 
331 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  30.53 
 
 
324 aa  149  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  35.37 
 
 
335 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  35.37 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  35.37 
 
 
335 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  35.08 
 
 
329 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  35.77 
 
 
335 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  35.98 
 
 
275 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  39.8 
 
 
338 aa  142  8e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  38.22 
 
 
307 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  34.55 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  35.02 
 
 
334 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  32.76 
 
 
311 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  31.82 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  32.76 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  32.66 
 
 
329 aa  132  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  31.71 
 
 
310 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  32.99 
 
 
333 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  33.19 
 
 
312 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  31.49 
 
 
318 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  24.49 
 
 
302 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  23.47 
 
 
302 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  24.49 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  18.73 
 
 
330 aa  43.5  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  21.68 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0301  cyclohexanone monooxygenase  31.71 
 
 
627 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0320  hypothetical protein  31.71 
 
 
627 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.429807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0310  hypothetical protein  31.71 
 
 
627 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>