46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0992 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 
321 aa  662    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  72.39 
 
 
307 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  60.45 
 
 
329 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  63.61 
 
 
334 aa  388  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  59.09 
 
 
329 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  57.68 
 
 
330 aa  377  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  59.67 
 
 
324 aa  372  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  59.16 
 
 
331 aa  368  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  62.63 
 
 
316 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  60.07 
 
 
311 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  61.38 
 
 
318 aa  362  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  59.79 
 
 
310 aa  362  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  57.76 
 
 
312 aa  359  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  55.92 
 
 
333 aa  357  9.999999999999999e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  58.7 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  54.92 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  54.92 
 
 
335 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  54.6 
 
 
335 aa  355  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  54.02 
 
 
331 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  54.02 
 
 
331 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  54.02 
 
 
331 aa  348  6e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  52.87 
 
 
338 aa  345  8e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  53.53 
 
 
335 aa  344  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  53.53 
 
 
335 aa  342  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  43.15 
 
 
275 aa  198  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  40.3 
 
 
275 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  41.08 
 
 
275 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  41.08 
 
 
275 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  40.08 
 
 
275 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  42.37 
 
 
275 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  36.92 
 
 
289 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  33.45 
 
 
302 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  32.67 
 
 
310 aa  149  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  32.76 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  39.57 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  26.67 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.9 
 
 
329 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  27.4 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.76 
 
 
325 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  30.67 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  26.67 
 
 
333 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  25.3 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  31.37 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  29.03 
 
 
309 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  28.92 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  23.42 
 
 
364 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>