46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5927 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 
307 aa  632  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  73.04 
 
 
321 aa  458  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  56.27 
 
 
329 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  60.2 
 
 
318 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  59.46 
 
 
334 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  60.54 
 
 
311 aa  363  2e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  57.58 
 
 
324 aa  362  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  55.52 
 
 
330 aa  360  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  60.96 
 
 
311 aa  360  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  58.36 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  62.77 
 
 
310 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  58.42 
 
 
331 aa  355  6.999999999999999e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  61.38 
 
 
316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  57.24 
 
 
329 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  52.37 
 
 
335 aa  338  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  53.82 
 
 
335 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  53.82 
 
 
335 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  55.63 
 
 
333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  53.85 
 
 
331 aa  331  7.000000000000001e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  53.85 
 
 
331 aa  331  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  53.85 
 
 
331 aa  331  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  51.83 
 
 
335 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  52.16 
 
 
335 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  55.09 
 
 
338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  41.41 
 
 
275 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  41.18 
 
 
275 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  41.18 
 
 
275 aa  189  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  40.87 
 
 
275 aa  188  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  41.03 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  41.2 
 
 
275 aa  176  5e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  32.4 
 
 
302 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  38.22 
 
 
289 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  32.06 
 
 
310 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  31.36 
 
 
302 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  35.48 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.72 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  27.24 
 
 
329 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  26.87 
 
 
333 aa  92.8  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  26.39 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  26.4 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  25.33 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  26.83 
 
 
325 aa  83.6  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  28.12 
 
 
309 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  29.73 
 
 
308 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  29.13 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  20.66 
 
 
364 aa  50.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>