42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0121 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 
364 aa  756    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0733  hypothetical protein  29.58 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  28.03 
 
 
310 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  28.03 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  27.2 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  26.27 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  26.27 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  22.39 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  23.08 
 
 
329 aa  69.7  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  26.07 
 
 
330 aa  66.2  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  24.55 
 
 
334 aa  64.3  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  26.15 
 
 
329 aa  63.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  24.06 
 
 
333 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  26.11 
 
 
331 aa  62  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  22.78 
 
 
311 aa  59.7  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  22.69 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  22.78 
 
 
311 aa  59.3  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  24.48 
 
 
324 aa  57.4  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  22.31 
 
 
318 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  23.92 
 
 
326 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  22.87 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  22.87 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  23.42 
 
 
321 aa  55.8  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  22.87 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  23.32 
 
 
312 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  23.4 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  21.81 
 
 
329 aa  54.7  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  23.72 
 
 
330 aa  54.3  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  21.88 
 
 
335 aa  53.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  22.63 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  22.63 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  22.63 
 
 
335 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  22.45 
 
 
333 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  21.29 
 
 
329 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  20.53 
 
 
335 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  20.66 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  22.57 
 
 
325 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  22.67 
 
 
338 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  24.05 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  22.98 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  21.29 
 
 
274 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>