41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1925 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  76.55 
 
 		 312 aa  475  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  73.08 
 
 		 309 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  26.25 
 
 		 364 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  30.04 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  28.02 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  29.81 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  29.33 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  27.87 
 
 		 329 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  30.95 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  28.79 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  26.85 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  31.37 
 
 		 321 aa  66.2  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  29.59 
 
 		 310 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  27.51 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  29.51 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  29.11 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  30.19 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  29.11 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  29.11 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  29.17 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  29.17 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  29.17 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  30.89 
 
 		 334 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  29.25 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  24.6 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  27.06 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  27.38 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  27.27 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  25.65 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  31.13 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  24.79 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  27.78 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  27.78 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  27.78 
 
 		 275 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  27.23 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  30.95 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  33.04 
 
 		 274 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0064  hypothetical protein  26.39 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>