60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3970 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  100 
 
 		 309 aa  617  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  73.4 
 
 		 312 aa  421  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  75.37 
 
 		 308 aa  417  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  26.27 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  27.84 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  29.95 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  29.47 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  27.1 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  27.71 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  28.7 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  28.44 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  28.44 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  28.44 
 
 		 335 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  26.6 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  28.24 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  28.12 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  27.78 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  25.73 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  25.12 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  29.03 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  26 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  27.06 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  25.11 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  27.85 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  26.15 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  26.15 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  24.19 
 
 		 333 aa  56.6  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  25.12 
 
 		 331 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  24.54 
 
 		 334 aa  55.8  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  26.4 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  23.68 
 
 		 324 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  27.15 
 
 		 275 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  24.69 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  24.69 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  29.13 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  24.69 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  23.83 
 
 		 338 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0308  hypothetical protein  24.86 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0170  hypothetical protein  24.72 
 
 		 284 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6152  hypothetical protein  26.82 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4658  hypothetical protein  25.7 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0163  hypothetical protein  24.16 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0077  hypothetical protein  24.86 
 
 		 286 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.490131 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  25.93 
 
 		 269 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0107  hypothetical protein  24.86 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0247  hypothetical protein  25.42 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104382 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3911  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  44.3  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7409  hypothetical protein  24.72 
 
 		 287 aa  44.3  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  28.02 
 
 		 274 aa  43.9  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_003296  RS02215  hypothetical protein  27.32 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  25.99 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0239  hypothetical protein  24.29 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3208  hypothetical protein  23.73 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0443  hypothetical protein  23.73 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00928843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0424  hypothetical protein  23.73 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1354  hypothetical protein  23.73 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0239  hypothetical protein  23.73 
 
 		 288 aa  42.7  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.644055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0366  hypothetical protein  23.73 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191928  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0606  hypothetical protein  23.73 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0073  hypothetical protein  23.73 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>