35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1228 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  48.28 
 
 		 274 aa  261  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  49.45 
 
 		 274 aa  251  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  32.41 
 
 		 275 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  32.02 
 
 		 275 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  33.2 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  33.2 
 
 		 277 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  34.34 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  33.85 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  32.42 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  32.42 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  32.42 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  32.42 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  32.42 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  32.42 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  32.42 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  33.51 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  34.54 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  33.2 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  33.2 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  35.14 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  33.2 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  33.2 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  32.41 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  32.41 
 
 		 275 aa  97.1  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  32.27 
 
 		 275 aa  95.9  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  33.33 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  29.41 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  28.68 
 
 		 312 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  25.93 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4173  hypothetical protein  25.79 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  25.62 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19440  hypothetical protein  26.51 
 
 		 271 aa  42  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.577003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>