34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3177 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  50.92 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  52.08 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  52.08 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  52.08 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  52.08 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  52.08 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  52.08 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  51.32 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  52.08 
 
 		 277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  50.36 
 
 		 277 aa  308  5e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  50.94 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  52.08 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  52.08 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  52.08 
 
 		 275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  52.08 
 
 		 275 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  51.7 
 
 		 275 aa  281  9e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  50.57 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  50.57 
 
 		 275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  48.86 
 
 		 275 aa  268  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  48.48 
 
 		 279 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  47.94 
 
 		 270 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  47.57 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  47.19 
 
 		 284 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  43.03 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  43.03 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  35.86 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  34.13 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  35.14 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3966  hypothetical protein  27.16 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575992  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  27.98 
 
 		 271 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4072  hypothetical protein  26.47 
 
 		 296 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000279639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  30.63 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4173  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>