31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3063 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  552  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  98.89 
 
 		 270 aa  547  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  86.67 
 
 		 284 aa  467  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  70.74 
 
 		 275 aa  391  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  69.63 
 
 		 279 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  52.42 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  52.42 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  52.42 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  52.42 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  52.42 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  52.42 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  52.42 
 
 		 277 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  52.04 
 
 		 277 aa  276  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  50.74 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  49.81 
 
 		 275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  50.74 
 
 		 275 aa  265  5e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  52.96 
 
 		 275 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  53.33 
 
 		 275 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  53.33 
 
 		 275 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  52.96 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  52.96 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  52.96 
 
 		 275 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  52.22 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  47.57 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  46.07 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  46.07 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  37.28 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  34.54 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  32.47 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4072  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000279639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  32.04 
 
 		 271 aa  42.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>