31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2701 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  573  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  97.45 
 
 
275 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  96 
 
 
275 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  96 
 
 
275 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  89.42 
 
 
277 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  88.32 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  94.91 
 
 
275 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  88.32 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  88.32 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  88.32 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  88.32 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  88.32 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  88.32 
 
 
277 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  88 
 
 
275 aa  510  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  87.64 
 
 
275 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  87.64 
 
 
275 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  52.08 
 
 
273 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  49.62 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  52.22 
 
 
270 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  52.22 
 
 
270 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  52.01 
 
 
284 aa  268  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  42.23 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  42.23 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  31.95 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  33.2 
 
 
269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  34.87 
 
 
274 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  23.98 
 
 
271 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4173  hypothetical protein  25.44 
 
 
270 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>