34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1889 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  558  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  76.78 
 
 
279 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  70 
 
 
270 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  70 
 
 
270 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  68.59 
 
 
284 aa  378  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  51.13 
 
 
277 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  50.75 
 
 
277 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  50.75 
 
 
277 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  50.75 
 
 
277 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  50.75 
 
 
277 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  50.75 
 
 
277 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  50.75 
 
 
277 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  50.75 
 
 
277 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  48.55 
 
 
275 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  49.81 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  49.81 
 
 
275 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  48.86 
 
 
273 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  50.18 
 
 
275 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  49.64 
 
 
275 aa  255  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  43.18 
 
 
274 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  43.18 
 
 
274 aa  230  2e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  34.07 
 
 
274 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  32.84 
 
 
274 aa  102  9e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  96.3  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  33.11 
 
 
275 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  33.55 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  33.55 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  33.55 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  30.97 
 
 
275 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>