30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0646 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  98.91 
 
 
275 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  90.18 
 
 
275 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  87.41 
 
 
277 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  87.41 
 
 
277 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  87.41 
 
 
277 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  87.41 
 
 
277 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  87.41 
 
 
277 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  87.41 
 
 
277 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  87.41 
 
 
277 aa  500  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  85.35 
 
 
277 aa  498  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  88 
 
 
275 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  88 
 
 
275 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  87.64 
 
 
275 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  88 
 
 
275 aa  480  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  87.64 
 
 
275 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  87.64 
 
 
275 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  86.91 
 
 
275 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  51.32 
 
 
273 aa  309  2.9999999999999997e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  49.81 
 
 
275 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  49.25 
 
 
279 aa  273  3e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  49.07 
 
 
270 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  49.07 
 
 
270 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  48.7 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  43.82 
 
 
274 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  43.82 
 
 
274 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  39.51 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  32.41 
 
 
269 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  34.87 
 
 
274 aa  108  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3911  hypothetical protein  29.41 
 
 
289 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0547466 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>