37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3399 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1467  hypothetical protein  48.53 
 
 
274 aa  265  8e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1228  hypothetical protein  48.28 
 
 
269 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1425  hypothetical protein  36.63 
 
 
279 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00131203  normal  0.0265706 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0646  hypothetical protein  34.87 
 
 
275 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3313  hypothetical protein  34.87 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.831581 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0246  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2458  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0746  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306684  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0733  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2377  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2700  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0912  hypothetical protein  35.38 
 
 
277 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.342604  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0424  hypothetical protein  34.87 
 
 
275 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482421  normal  0.804892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0605  hypothetical protein  34.87 
 
 
277 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3177  hypothetical protein  34.13 
 
 
273 aa  102  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  32.84 
 
 
275 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0625  hypothetical protein  36.6 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6000  hypothetical protein  35.95 
 
 
275 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2672  hypothetical protein  35.95 
 
 
275 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.328222  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2701  hypothetical protein  35.95 
 
 
275 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2061  hypothetical protein  35.95 
 
 
275 aa  94  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0461998  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2597  hypothetical protein  35.95 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2725  hypothetical protein  35.95 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3409  hypothetical protein  31.44 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603479 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3063  hypothetical protein  31.44 
 
 
270 aa  88.2  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3135  hypothetical protein  31.31 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.900855  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1463  hypothetical protein  29.91 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1786  hypothetical protein  29.91 
 
 
274 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3966  hypothetical protein  25.81 
 
 
262 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575992  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  33.63 
 
 
312 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0239  hypothetical protein  26.26 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3017  hypothetical protein  33.03 
 
 
251 aa  45.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal  0.0289582 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  33.04 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  28.02 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0247  hypothetical protein  25.82 
 
 
287 aa  42.7  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104382 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0064  hypothetical protein  27.01 
 
 
267 aa  42  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>