46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0247 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0247  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  588  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104382 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0239  hypothetical protein  87.23 
 
 
295 aa  502  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4658  hypothetical protein  81.36 
 
 
289 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5164  hypothetical protein  83.09 
 
 
285 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0308  hypothetical protein  81.25 
 
 
289 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0170  hypothetical protein  78.8 
 
 
284 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0200  hypothetical protein  79.93 
 
 
290 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0073  hypothetical protein  80.59 
 
 
291 aa  471  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0606  hypothetical protein  80.59 
 
 
291 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0366  hypothetical protein  78.52 
 
 
291 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2923  hypothetical protein  79.49 
 
 
292 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.748941 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0396  hypothetical protein  79.85 
 
 
291 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289257  normal  0.0165478 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3208  hypothetical protein  80.51 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0443  hypothetical protein  80.51 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00928843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0424  hypothetical protein  80.51 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1354  hypothetical protein  80.51 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0239  hypothetical protein  80.51 
 
 
288 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.644055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2908  hypothetical protein  79.49 
 
 
292 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0570741  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2294  hypothetical protein  79.49 
 
 
292 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0077  hypothetical protein  78.65 
 
 
286 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.490131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4230  hypothetical protein  79.2 
 
 
290 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6251  hypothetical protein  79.49 
 
 
292 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0163  hypothetical protein  78.45 
 
 
284 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6000  hypothetical protein  78.93 
 
 
283 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3911  hypothetical protein  79.21 
 
 
289 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2957  hypothetical protein  79.49 
 
 
292 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7409  hypothetical protein  79.78 
 
 
287 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5635  hypothetical protein  78.93 
 
 
283 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0486  hypothetical protein  78.83 
 
 
290 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0607779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2820  hypothetical protein  79.49 
 
 
292 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239639  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6491  hypothetical protein  78.21 
 
 
283 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.725464  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6152  hypothetical protein  79.41 
 
 
283 aa  462  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0107  hypothetical protein  80.15 
 
 
284 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0451  hypothetical protein  71.69 
 
 
287 aa  417  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0484  hypothetical protein  71.69 
 
 
287 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0479  hypothetical protein  71.69 
 
 
287 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.323829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3500  hypothetical protein  71 
 
 
282 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111206  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0378  Conserved hypothetical protein. putative conserved domain  67.14 
 
 
285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00161389  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0199  hypothetical protein  67.14 
 
 
285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02215  hypothetical protein  59.56 
 
 
273 aa  335  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4072  hypothetical protein  28.64 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000279639  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4173  hypothetical protein  27 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  29.31 
 
 
271 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3966  hypothetical protein  27.75 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575992  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  25.42 
 
 
309 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3399  hypothetical protein  25.82 
 
 
274 aa  42.7  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402196  normal  0.952996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>