47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4130 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  99.27 
 
 
275 aa  553  1e-157  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  80.73 
 
 
275 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  81.82 
 
 
275 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  73.45 
 
 
275 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  38.64 
 
 
331 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  41.08 
 
 
321 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  41.18 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  35.84 
 
 
330 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  38.58 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  38.25 
 
 
316 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  35.74 
 
 
329 aa  175  8e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  33.96 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  37.31 
 
 
311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  36.93 
 
 
329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  35.02 
 
 
334 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  36.11 
 
 
333 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  33.58 
 
 
335 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  37.07 
 
 
311 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  33.58 
 
 
335 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  33.58 
 
 
335 aa  168  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  34.23 
 
 
331 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  33.58 
 
 
335 aa  168  8e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  34.23 
 
 
331 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  34.23 
 
 
331 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  37.55 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  36.74 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  32.72 
 
 
338 aa  163  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  35.71 
 
 
310 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  36.97 
 
 
289 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  30.69 
 
 
276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  29.44 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  29.03 
 
 
302 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  29.03 
 
 
310 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  23.94 
 
 
308 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  27.78 
 
 
308 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  22.78 
 
 
330 aa  54.7  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  25.4 
 
 
329 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  24.69 
 
 
309 aa  52  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  28.57 
 
 
329 aa  52.4  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1889  hypothetical protein  33.55 
 
 
275 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864929  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  21.51 
 
 
333 aa  46.6  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  25.99 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  21.97 
 
 
326 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  27.33 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2453  hypothetical protein  27.72 
 
 
200 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>