46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1811 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 
311 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  92.28 
 
 
311 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  69.16 
 
 
329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  71.28 
 
 
310 aa  434  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  66.78 
 
 
316 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  57.14 
 
 
329 aa  369  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  56.59 
 
 
312 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  61.09 
 
 
307 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  53.42 
 
 
330 aa  358  8e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  58.7 
 
 
321 aa  358  9e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  58.05 
 
 
318 aa  350  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  54.58 
 
 
334 aa  343  2.9999999999999997e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  51.59 
 
 
335 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  51.59 
 
 
335 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  50.96 
 
 
338 aa  334  1e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  51.27 
 
 
335 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  52.58 
 
 
324 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  55.18 
 
 
333 aa  326  3e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  50.47 
 
 
331 aa  326  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  48.28 
 
 
335 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  49.36 
 
 
331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  49.36 
 
 
331 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  49.36 
 
 
331 aa  325  5e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  47.34 
 
 
335 aa  318  1e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  37.55 
 
 
275 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  37.36 
 
 
275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  37.31 
 
 
275 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  37.31 
 
 
275 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  39.36 
 
 
275 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  38.78 
 
 
275 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  32.76 
 
 
289 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  30.63 
 
 
302 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  29.89 
 
 
310 aa  127  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  29.89 
 
 
302 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.23 
 
 
326 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  32.28 
 
 
276 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  27.03 
 
 
329 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  25.68 
 
 
330 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  27.01 
 
 
329 aa  99.8  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.33 
 
 
325 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  26.13 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  25.09 
 
 
308 aa  86.7  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  29.33 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  29.95 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  22.78 
 
 
364 aa  58.9  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>