46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2173 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2173  fatty acid desaturase type 2  100 
 
 
329 aa  681    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1820  fatty acid desaturase, type 2  71.19 
 
 
311 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0523547  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1811  fatty acid desaturase type 2  69.97 
 
 
311 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.156442  hitchhiker  0.0000155427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1903  hypothetical protein  65.76 
 
 
310 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3578  fatty acid desaturase type 2  63.89 
 
 
316 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.327469  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3535  fatty acid desaturase type 2  56.19 
 
 
329 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0307  fatty acid desaturase, type 2  56.37 
 
 
312 aa  371  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0992  fatty acid desaturase type 2  59.52 
 
 
321 aa  370  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3918  fatty acid desaturase type 2  52.29 
 
 
330 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6505  fatty acid desaturase type 2  59.93 
 
 
318 aa  360  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0478393  normal  0.21455 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3536  fatty acid desaturase type 2  55.56 
 
 
334 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1946  fatty acid desaturase type 2  53.04 
 
 
324 aa  355  3.9999999999999996e-97  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.323974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5927  fatty acid desaturase, type 2  57.24 
 
 
307 aa  352  5e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4940  fatty acid desaturase, type 2  51.55 
 
 
335 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2141  fatty acid desaturase type 2  51.58 
 
 
331 aa  332  4e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.130014  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5028  fatty acid desaturase, type 2  51.55 
 
 
335 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5321  fatty acid desaturase, type 2  49.69 
 
 
335 aa  331  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10839  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA1  49.38 
 
 
338 aa  329  4e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.8850299999999998e-27  hitchhiker  0.0000114549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4894  fatty acid desaturase, type 2  50 
 
 
331 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.688927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4511  fatty acid desaturase, type 2  50 
 
 
331 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4598  fatty acid desaturase, type 2  50 
 
 
331 aa  328  8e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1668  fatty acid desaturase, type 2  48.12 
 
 
335 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5085  fatty acid desaturase, type 2  47.5 
 
 
335 aa  321  8e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4144  fatty acid desaturase type 2  54.64 
 
 
333 aa  321  9.000000000000001e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4361  fatty acid desaturase, type 2  36.93 
 
 
275 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4130  fatty acid desaturase, type 2  36.93 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4205  fatty acid desaturase, type 2  36.93 
 
 
275 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486224 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4653  fatty acid desaturase, type 2  38.17 
 
 
275 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.424054  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2061  fatty acid desaturase, type 2  36.51 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.1094 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11115  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase desA2  38.08 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00275756  normal  0.545687 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2162  putative acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  32.22 
 
 
302 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1064  fatty acid desaturase type 2  32.22 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.183632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2881  acyl-[acyl-carrier protein] desaturase  31.85 
 
 
310 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1664  fatty acid desaturase type 2  32.66 
 
 
289 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3129  putative fatty acid desaturase  28.81 
 
 
276 aa  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.353382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1163  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  27.31 
 
 
326 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.100764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0968  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  28.81 
 
 
330 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15111  predicted protein  29.68 
 
 
329 aa  95.9  9e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.430971  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9316  predicted protein  24.74 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4583  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  30.11 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.489587  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03705  DesA1  29.03 
 
 
333 aa  87  3e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5690  Acyl-(acyl-carrier-protein) desaturase  27.17 
 
 
329 aa  87  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1925  hypothetical protein  27.64 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4170  hypothetical protein  25.4 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3970  putative acyl-(acyl-carrier protein) desaturase  26.6 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0121  fatty acid desaturase, type 2  26.15 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00366287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>