118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0961 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  100 
 
 		 249 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  79.67 
 
 		 258 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  79.01 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  79.01 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  79.01 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  79.01 
 
 		 257 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  78.21 
 
 		 244 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  47.79 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  47.79 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  47.39 
 
 		 260 aa  191  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  46.5 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  42.54 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  42.54 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  42.54 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  42.54 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  42.54 
 
 		 280 aa  174  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  43.81 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  45.41 
 
 		 253 aa  162  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  48.39 
 
 		 326 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  37.8 
 
 		 284 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  36.61 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  36.61 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  36.61 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  36.91 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  34.57 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  34.57 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  34.57 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 		 277 aa  102  8e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 		 277 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 		 277 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  33.74 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  32.91 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  34.97 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  33.18 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  31.8 
 
 		 309 aa  72  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  31.8 
 
 		 309 aa  72  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  34.12 
 
 		 188 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  33.8 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2123  putative IS493-like transposase  64.71 
 
 		 76 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.701384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  28.64 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  28.18 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  28.18 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  28.18 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  28.18 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  32.24 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  27.73 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  27.73 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  27.73 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  27.73 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  27.73 
 
 		 330 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  29.93 
 
 		 352 aa  55.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4706  hypothetical protein  32.56 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  25.38 
 
 		 255 aa  52.8  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1269  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 287 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3399  transposase IS4 family protein  29.27 
 
 		 186 aa  52.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0173  hypothetical protein  25.89 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.372645  normal  0.496581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2719  transposase, IS4  30.08 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0844  transposase, IS4  30.08 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2007  transposase, IS4  30.08 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2191  transposase, IS4  30.08 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00429854  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2197  transposase, IS4  30.08 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.151302  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  30.72 
 
 		 162 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  25.25 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  25.25 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  25.51 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  25.25 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  25.64 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  25.64 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  25.89 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  25.64 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  25.89 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  25.64 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  25.64 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  25.64 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5439  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.948366  normal  0.697595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2666  transposase, IS4 family protein  27.61 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2904  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2980  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3108  transposase, IS4 family protein  27.81 
 
 		 298 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202313  normal  0.706034 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>