89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2546 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1122  transposase  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  90.97 
 
 		 277 aa  520  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  90.97 
 
 		 277 aa  520  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  90.61 
 
 		 277 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  90.61 
 
 		 277 aa  517  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  89.53 
 
 		 277 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  82.74 
 
 		 282 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  63.72 
 
 		 211 aa  261  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  72 
 
 		 188 aa  256  3e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  54.61 
 
 		 292 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  44.28 
 
 		 284 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  44.28 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  44.28 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  44.28 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  45.02 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  36.57 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  36.57 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  36.57 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  36.57 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  36.57 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4215  hypothetical protein  72 
 
 		 122 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  33.09 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 260 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  34.57 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.95 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 257 aa  99.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  34.67 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  34.17 
 
 		 274 aa  86.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  36.73 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  29.77 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  29.32 
 
 		 352 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5439  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.948366  normal  0.697595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2904  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2980  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3108  transposase, IS4 family protein  28.14 
 
 		 298 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202313  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  28.79 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2666  transposase, IS4 family protein  27.39 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  30.7 
 
 		 275 aa  48.1  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  29.82 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  30.7 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  30.7 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  27.18 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  29.82 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  29.82 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  25.62 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  29.82 
 
 		 238 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  28.95 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  26.19 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  26.19 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  26.19 
 
 		 247 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>