57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4217 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  70.74 
 
 		 277 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  70.74 
 
 		 277 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  70.74 
 
 		 277 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  68.09 
 
 		 277 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  68.09 
 
 		 277 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  68.09 
 
 		 277 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  68.09 
 
 		 277 aa  261  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  67.55 
 
 		 277 aa  258  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  58.99 
 
 		 292 aa  193  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  68.18 
 
 		 282 aa  159  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  68.29 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  46.7 
 
 		 269 aa  131  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  46.7 
 
 		 269 aa  131  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  46.7 
 
 		 269 aa  131  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  43.41 
 
 		 284 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  43.35 
 
 		 269 aa  105  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  36.63 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  36.63 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  37.3 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  34.76 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  31.84 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  34.12 
 
 		 249 aa  71.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  34.34 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  35.2 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  35.8 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  32.94 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  28.03 
 
 		 272 aa  52  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  27.82 
 
 		 276 aa  48.9  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  48.5  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  27.82 
 
 		 255 aa  48.1  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  47.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  47.8  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  29.51 
 
 		 260 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  29.51 
 
 		 260 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  28.57 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  28.57 
 
 		 275 aa  47.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  29.23 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  27.07 
 
 		 275 aa  46.2  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  27.82 
 
 		 275 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1717  hypothetical protein  29.69 
 
 		 249 aa  44.3  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  29.63 
 
 		 259 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>