106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3646 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  100 
 
 
260 aa  523  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  68.46 
 
 
260 aa  343  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  68.46 
 
 
260 aa  343  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  70.38 
 
 
259 aa  338  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  64.5 
 
 
274 aa  282  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  57.94 
 
 
253 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  50.19 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  50.19 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  50.19 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  50.19 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  50.19 
 
 
280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  67.91 
 
 
326 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  45.21 
 
 
258 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
257 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
257 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
257 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  43.7 
 
 
257 aa  192  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  47.39 
 
 
249 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  42.92 
 
 
244 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  38.24 
 
 
284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
269 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
269 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  38.46 
 
 
269 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  38.49 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  33.09 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  33.09 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  33.09 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  32.12 
 
 
277 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  31.75 
 
 
277 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  31.75 
 
 
277 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  31.75 
 
 
277 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  34.29 
 
 
292 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  31.39 
 
 
277 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  30.58 
 
 
211 aa  89  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  33 
 
 
282 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  34.13 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1614  hypothetical protein  63.16 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  31.12 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  32.37 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1315  hypothetical protein  63.89 
 
 
116 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  27.31 
 
 
330 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  27.57 
 
 
272 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  31.8 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  31.8 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  27.91 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  28.44 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  27.65 
 
 
255 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  26.98 
 
 
275 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  26.98 
 
 
275 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  28.11 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  28.11 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  28.11 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  28.11 
 
 
275 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  26.51 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  28 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  28 
 
 
238 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  28.11 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  28.11 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  27.49 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2123  putative IS493-like transposase  50 
 
 
76 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.701384  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  33.1 
 
 
162 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  30.15 
 
 
352 aa  55.5  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0173  hypothetical protein  27.08 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.372645  normal  0.496581 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1269  transposase IS4 family protein  26.2 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3399  transposase IS4 family protein  27.5 
 
 
186 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  23.42 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  23.42 
 
 
247 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>