104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4558 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 274 aa  549  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  68.02 
 
 		 260 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  64.5 
 
 		 260 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  68.16 
 
 		 259 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  59.45 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  65.56 
 
 		 326 aa  196  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  47.75 
 
 		 280 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  47.75 
 
 		 280 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  47.75 
 
 		 280 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  47.75 
 
 		 280 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  47.75 
 
 		 280 aa  192  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  44.69 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  43.95 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  43.35 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  38.77 
 
 		 284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  37.89 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  37.89 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  37.89 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  35.71 
 
 		 292 aa  96.3  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  34.17 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  34.17 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  34.17 
 
 		 277 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  33.19 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  33.19 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  33.19 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  33.19 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  32.77 
 
 		 277 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  35.81 
 
 		 324 aa  81.6  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  32.71 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  33.64 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  33.64 
 
 		 309 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1614  hypothetical protein  63.64 
 
 		 81 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  31.76 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  25.25 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  25.25 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  25.25 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  25.25 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  25.25 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  33.53 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  25.5 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  24.74 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  25.76 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  25.39 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  25.39 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  25.76 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  25.76 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  25.76 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  25.76 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  25.76 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  25.76 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  25.76 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  25.76 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  25.76 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  25.76 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  30.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  34.85 
 
 		 162 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  27.57 
 
 		 330 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1315  hypothetical protein  67.57 
 
 		 116 aa  53.1  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0173  hypothetical protein  27.51 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.372645  normal  0.496581 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  25.58 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  25.58 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  28.5 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  28.5 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  28.5 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  28.5 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  27.1 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3432  transposase IS4 family protein  29.95 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>