93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0183 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  50.19 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  49.43 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  49.43 
 
 		 260 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  48.66 
 
 		 259 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  48.43 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  47.6 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  42.8 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  42.91 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  42.91 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  42.91 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  42.91 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  42.54 
 
 		 249 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 244 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  39.64 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  45.86 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  38.06 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  38.06 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  38.06 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  37.64 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  37.27 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  37.27 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  37.27 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  36.9 
 
 		 277 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  41.26 
 
 		 211 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  36.57 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  36.57 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  36.57 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  40.45 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  39.21 
 
 		 292 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  36.75 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  37.06 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1269  transposase IS4 family protein  30.65 
 
 		 287 aa  65.1  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1999  transposase IS4 family protein  30.84 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0143016  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  25.91 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  30.84 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3432  transposase IS4 family protein  30.87 
 
 		 262 aa  62  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  26.94 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  32.76 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  26.94 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2123  putative IS493-like transposase  51.56 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.701384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  25.13 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  28.06 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  28.06 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  28.06 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  27.4 
 
 		 330 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  28.06 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  28.06 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  28.06 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  28.06 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  28.35 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  28.35 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  28.35 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  25.52 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  26.53 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3429  transposase IS4 family protein  30.43 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  26.53 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  25.26 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1315  hypothetical protein  47.22 
 
 		 116 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  26.84 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 162 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  29.18 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  29.18 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  29.18 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4007  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4258  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2882  transposase IS4 family protein  26.94 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4509  transposase IS4 family protein  26.73 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2986  transposase IS4 family protein  26.73 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2719  transposase, IS4  31.2 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0844  transposase, IS4  31.2 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2197  transposase, IS4  31.2 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.151302  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2191  transposase, IS4  31.2 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00429854  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2007  transposase, IS4  31.2 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4706  hypothetical protein  28.51 
 
 		 258 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3942  transposase, IS4 family protein  28.66 
 
 		 197 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1614  hypothetical protein  41.07 
 
 		 81 aa  43.9  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2666  transposase, IS4 family protein  24.27 
 
 		 298 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3108  transposase, IS4 family protein  24.27 
 
 		 298 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202313  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2980  transposase, IS4 family protein  24.27 
 
 		 298 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.528194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5439  transposase, IS4 family protein  24.27 
 
 		 298 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.948366  normal  0.697595 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2904  transposase, IS4 family protein  24.27 
 
 		 298 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.167457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>