78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3115 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 162 aa  330  7.000000000000001e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  74.07 
 
 		 259 aa  241  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3023  transposase IS4 family protein  80.82 
 
 		 111 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2844  hypothetical protein  66.27 
 
 		 83 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  37.93 
 
 		 260 aa  70.5  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  37.93 
 
 		 260 aa  70.5  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  35.42 
 
 		 259 aa  60.8  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  33.1 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  32.69 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  30.13 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  34.85 
 
 		 274 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  30.72 
 
 		 249 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  29.52 
 
 		 253 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  30.26 
 
 		 257 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  30.26 
 
 		 257 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  30.26 
 
 		 257 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  30.26 
 
 		 257 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0575  hypothetical protein  25.17 
 
 		 275 aa  48.9  0.00003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0448  hypothetical protein  25.17 
 
 		 275 aa  48.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1451  hypothetical protein  24.5 
 
 		 276 aa  47.8  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1845  hypothetical protein  23.84 
 
 		 255 aa  47.4  0.00009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.072763 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0553  hypothetical protein  23.45 
 
 		 272 aa  47  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000297126 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0992  hypothetical protein  26.02 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.160605 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1055  hypothetical protein  26.02 
 
 		 260 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.719775 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  29.58 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1316  hypothetical protein  24.5 
 
 		 275 aa  46.2  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1904  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0586  hypothetical protein  24.52 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1056  hypothetical protein  24.52 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.776166 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1117  hypothetical protein  24.52 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.281575 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1388  hypothetical protein  24.52 
 
 		 275 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1953  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1478  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1566  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.706512 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1652  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1780  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.170246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1848  hypothetical protein  24.52 
 
 		 255 aa  45.4  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.278285 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1738  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  43.9  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3899  transposase IS702 family protein  28.87 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5798  transposase IS5 family protein  28.87 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5812  transposase IS5 family protein  28.87 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3862  hypothetical protein  28.87 
 
 		 273 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2719  transposase, IS4  29.71 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0157  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00114927  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2007  transposase, IS4  29.71 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0101  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000553926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0247  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186858  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0302  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.140022  normal  0.385291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0539  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0478326  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0635  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000109907  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0751  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000459793  hitchhiker  0.00109121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0834  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000820934  unclonable  0.0000181731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1221  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000020949  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1383  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000158375  hitchhiker  0.00331132 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1477  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000136224  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1873  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00916179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2345  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2390  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.082083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3274  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000259909  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3382  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000182437  hitchhiker  0.00538438 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3389  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141638  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3833  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4033  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000656142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4083  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0538175  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4095  transposase, IS4 family protein  27.14 
 
 		 352 aa  42  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00617588  normal  0.763291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2197  transposase, IS4  29.71 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.151302  normal  0.432769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2191  transposase, IS4  29.71 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00429854  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0844  transposase, IS4  29.71 
 
 		 335 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.685404  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01920  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  41.6  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.294605  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  28.57 
 
 		 277 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3103  hypothetical protein  74.07 
 
 		 104 aa  40.8  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  28.57 
 
 		 277 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  28.57 
 
 		 277 aa  40.8  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2552  hypothetical protein  41.07 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>