11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2844 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2844  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  170  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  69.88 
 
 		 259 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  66.27 
 
 		 162 aa  114  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3023  transposase IS4 family protein  86.96 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  31.25 
 
 		 258 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3399  transposase IS4 family protein  30.38 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4523  transposase IS4 family protein  35 
 
 		 330 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0208  transposase IS4 family protein  35 
 
 		 330 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000590832 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1566  transposase IS4 family protein  35 
 
 		 330 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3330  transposase IS4 family protein  35 
 
 		 330 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.621981 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3998  transposase IS4 family protein  35 
 
 		 330 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.936771 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>