22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4215 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4215  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  73.27 
 
 		 277 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  73.27 
 
 		 277 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  73.27 
 
 		 277 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  72 
 
 		 277 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  72 
 
 		 277 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  72 
 
 		 277 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  72.28 
 
 		 277 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  70.3 
 
 		 277 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  69.31 
 
 		 282 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  61.8 
 
 		 211 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  48 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  49.43 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  49.43 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  49.43 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  58.43 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  58.11 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 280 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>