25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1350 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1350  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  741    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2177  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.35 
 
 		 755 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.469319  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2736  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.36 
 
 		 748 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3568  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  33.33 
 
 		 550 aa  83.2  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1630  diguanylate cyclase with GAF sensor  32.43 
 
 		 739 aa  83.6  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3301  hypothetical protein  29.89 
 
 		 751 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.793369  normal  0.543821 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1116  putative metal dependent phosphohydrolase  33.12 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2176  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.54 
 
 		 726 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.456446 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0060  hypothetical protein  30.61 
 
 		 413 aa  67  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.839104 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1324  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  29.53 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.799769  normal  0.369504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2643  metal dependent phosphohydrolase  29.05 
 
 		 861 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.120686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1274  diguanylate cyclase  32.17 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1062  GGDEF domain-containing protein  24.76 
 
 		 438 aa  52.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3556  cyclic nucleotide phosphodiesterase, putative  27.59 
 
 		 420 aa  49.7  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2977  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.59 
 
 		 420 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00653493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3059  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.59 
 
 		 420 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0288592  normal  0.515821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1034  diguanylate cyclase  27.59 
 
 		 417 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.283599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15930  metal dependent phosphohydrolase  30.52 
 
 		 718 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3257  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.59 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0304774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1135  diguanylate cyclase  27.59 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1101  diguanylate cyclase  27.59 
 
 		 417 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1332  GGDEF domain-containing protein  27.2 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.228796 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3157  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.72 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00178016  normal  0.867021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0036  diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000170685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1557  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.22 
 
 		 741 aa  43.1  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>