More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0397 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0397  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 156 aa  311  2.9999999999999996e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0103931 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 161 aa  107  6e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  36.48 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  37.97 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 171 aa  103  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  39.35 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 161 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  38.61 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  37.11 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  41.5 
 
 		 153 aa  100  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  37.97 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  39.62 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  35.67 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  38.99 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  39.31 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0163  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000328888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 176 aa  99  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  34.19 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  36.94 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  35.67 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 156 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  37.34 
 
 		 162 aa  97.4  6e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 156 aa  97.1  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 159 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 158 aa  96.3  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 162 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  38.78 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  35.67 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 165 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  37.97 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  38 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  42.25 
 
 		 160 aa  94.7  4e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 174 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  35.44 
 
 		 176 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 172 aa  94  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0552  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 156 aa  94.4  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0537746 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  35.44 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 168 aa  94  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>