254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0243 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0243  GatB/YqeY domain-containing protein  100 
 
 
147 aa  293  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00190  hypothetical protein  70.07 
 
 
147 aa  204  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.348868  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  38.89 
 
 
147 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  38.89 
 
 
147 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  38.89 
 
 
147 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  38.89 
 
 
147 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  36.62 
 
 
151 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  38.89 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  40.74 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  38.17 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.76 
 
 
147 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  40.28 
 
 
147 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  37.21 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  38.46 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  38.81 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  37.5 
 
 
147 aa  95.9  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  40.74 
 
 
151 aa  95.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  38.19 
 
 
147 aa  94.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  37.76 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  34.67 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  38.93 
 
 
145 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  38.03 
 
 
151 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  39.16 
 
 
147 aa  94  6e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  35.86 
 
 
147 aa  93.6  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  36.81 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  37.32 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  38.76 
 
 
147 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  36.11 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  92  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  37.24 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  36.55 
 
 
156 aa  90.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  38.41 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  36.11 
 
 
150 aa  90.5  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  32.41 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  35.66 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  36.5 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  34 
 
 
146 aa  89  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  35.92 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  36.05 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  40.85 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  37.69 
 
 
148 aa  89  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  35.11 
 
 
150 aa  89  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  37.32 
 
 
147 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  37.5 
 
 
151 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  38.52 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  38.46 
 
 
148 aa  87.8  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  38.52 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07550  hypothetical protein  34.51 
 
 
149 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.337543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  34.51 
 
 
149 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  35.88 
 
 
147 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  35.88 
 
 
148 aa  87.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2324  hypothetical protein  34.51 
 
 
148 aa  87  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000175951  hitchhiker  0.0063416 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  34.48 
 
 
147 aa  87  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  34.81 
 
 
149 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  37.4 
 
 
148 aa  87  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2695  hypothetical protein  32.41 
 
 
147 aa  86.7  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000269133  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  34.03 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  34.03 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  34.97 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  37.04 
 
 
149 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  35.92 
 
 
147 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  36.03 
 
 
153 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  36.05 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  31.94 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  35.92 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  38.81 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  34.53 
 
 
148 aa  84.3  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  36.62 
 
 
149 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1808  hypothetical protein  32.87 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171328  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  35.88 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  32.82 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  35.92 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0434  GatB/Yqey domain-containing protein  37.06 
 
 
150 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598913  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  34.85 
 
 
149 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  34.93 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  35.88 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  34.35 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  35.38 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  35.37 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  39.42 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  39.42 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  39.42 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  39.42 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  30.99 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  39.42 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2339  GatB/Yqey domain protein  32.87 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.993479  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  35.66 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1973  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0436471  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  39.42 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  39.42 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  37.4 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  35.88 
 
 
148 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>