243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00190  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  287  3e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.348868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0243  GatB/YqeY domain-containing protein  70.07 
 
 		 147 aa  204  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0043  hypothetical protein  39.29 
 
 		 156 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.397691  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0998  GatB/Yqey domain-containing protein  38.85 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00801426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  36.81 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0960  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000046102  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12740  GatB/Yqey domain protein  34.03 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.419894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  36.55 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  38.41 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3167  GatB/YqeY domain protein  37.86 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000266717  normal  0.23935 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1074  GatB/YqeY domain-containing protein  35.97 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0455696  normal  0.725316 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1223  GatB/YqeY domain-containing protein  37.86 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000223047  normal  0.540542 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1155  GatB/YqeY domain-containing protein  37.41 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000287831  normal  0.0330324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1190  GatB/Yqey domain-containing protein  37.86 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000373209  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1146  GatB/Yqey domain-containing protein  37.86 
 
 		 147 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000561495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2948  GatB/Yqey domain-containing protein  38.69 
 
 		 151 aa  86.7  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.458577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1192  GatB/YqeY domain protein  37.12 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0898775  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2832  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  84.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0718  hypothetical protein  36.8 
 
 		 149 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00318634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  31.88 
 
 		 150 aa  83.6  8e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  39.23 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1040  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000624068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2994  GatB/Yqey domain-containing protein  37.23 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0302156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  35 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  34.06 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1106  GatB/Yqey domain-containing protein  35.25 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000329477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0825  hypothetical protein  37.41 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000825752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1226  hypothetical protein  32.56 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000530099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3018  hypothetical protein  33.58 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.201617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0312  GatB/Yqey domain-containing protein  40.16 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0301351  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1287  hypothetical protein  34.53 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001622  hypothetical protein  37.4 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000215544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4336  GatB/YqeY domain-containing protein  33.33 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1236  hypothetical protein  36.73 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03455  GatB/YqeY domain protein  35.97 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000622771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  33.11 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1988  hypothetical protein  38.06 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0993451  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  34.97 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00850  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  34.06 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  36.64 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2859  GatB/Yqey domain-containing protein  34.9 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.995117  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  35.92 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  37.78 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  36.15 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2055  GatB/YqeY family protein  34.62 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  33.57 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  31.88 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  34.06 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  34.78 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  34.27 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0968  hypothetical protein  34.69 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  34.06 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  32.84 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  34.4 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  35.51 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  36.73 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0985  GatB/YqeY domain-containing protein  34.38 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269518  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  30.77 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1700  GatB/Yqey domain-containing protein  38.17 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1472  GatB/YqeY  31.79 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  35.34 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  34.75 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2091  GatB/Yqey domain-containing protein  34.03 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  32.87 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  33.33 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0046  hypothetical protein  34.88 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137941  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1782  GatB/YqeY domain-containing protein  31.25 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0395  GatB/Yqey domain protein  31.25 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.675742  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  32.8 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1099  GatB/Yqey domain-containing protein  37.68 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  33.79 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  32.64 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  33.79 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2988  GatB/Yqey domain-containing protein  35.25 
 
 		 147 aa  72  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000480626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4291  GatB/YqeY domain-containing protein  36.57 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000223444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  32.61 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1785  hypothetical protein  34.31 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000520895 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  34.69 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  34.04 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0721  hypothetical protein  31.69 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>