More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ecaj_R0013 on replicon NC_007354
Organism: Ehrlichia canis str. Jake



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  Wp16SA  16S ribosomal RNA  88.16 
 
 
1447 bp  1398    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0043  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 
1460 bp  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0013  16S ribosomal RNA  100 
 
 
1485 bp  2944    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0017  16S ribosomal RNA  86.68 
 
 
1460 bp  684    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.959999  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0973  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 
1498 bp  1088    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.628472  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0919  16S ribosomal RNA  98.25 
 
 
1509 bp  2724    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  85.51 
 
 
1477 bp  620  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  85.51 
 
 
1477 bp  620  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  85.51 
 
 
1477 bp  620  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  85.51 
 
 
1477 bp  620  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0054  16S ribosomal RNA  85.62 
 
 
1478 bp  617  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0050  16S ribosomal RNA  85.62 
 
 
1478 bp  617  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0041  16S ribosomal RNA  85.62 
 
 
1478 bp  617  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0054  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 
1476 bp  613  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0010  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 
1476 bp  613  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0072  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 
1476 bp  613  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0018  16S ribosomal RNA  86.21 
 
 
1476 bp  613  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0021  16S ribosomal RNA  85.7 
 
 
1479 bp  613  1e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0258  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 
1472 bp  603  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1086  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 
1472 bp  603  1e-170  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0044  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 
1459 bp  601  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0054  16S ribosomal RNA  85.36 
 
 
1459 bp  601  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0018  16S ribosomal RNA  85.09 
 
 
1478 bp  595  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280961  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0006  16S ribosomal RNA  85.09 
 
 
1478 bp  595  1e-167  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1794  16S ribosomal RNA  85.66 
 
 
1454 bp  591  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00503933  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r03  16S ribosomal RNA  85.66 
 
 
1491 bp  591  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.048775  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r06  16S ribosomal RNA  85.66 
 
 
1491 bp  591  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.083169  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr03  16S ribosomal RNA  85.66 
 
 
1454 bp  591  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1022  16S ribosomal RNA  85.66 
 
 
1454 bp  591  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1586  16S ribosomal RNA  85.66 
 
 
1454 bp  591  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0056  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1474 bp  573  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347573  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0040  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1469 bp  573  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0049  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1469 bp  573  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0054  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1469 bp  573  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.859756  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0042  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1474 bp  573  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.087372  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0051  16S ribosomal RNA  85.44 
 
 
1461 bp  575  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0051  16S ribosomal RNA  85.46 
 
 
1474 bp  573  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26221  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0029  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 
1486 bp  571  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0015  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 
1486 bp  571  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.857028  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0035  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 
1486 bp  571  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0064  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 
1486 bp  571  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00897748  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0005  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 
1480 bp  567  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0053  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 
1480 bp  567  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0063  16S ribosomal RNA  85.14 
 
 
1480 bp  567  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675179  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6501  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1485 bp  565  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6504  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1485 bp  565  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4501  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1485 bp  565  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4504  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1485 bp  565  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0036  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 
1460 bp  551  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.708988  normal  0.0771921 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0048  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 
1460 bp  551  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.211125 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0063  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 
1460 bp  551  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.29045  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0055  16S ribosomal RNA  86.7 
 
 
1460 bp  551  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0057  16S ribosomal RNA  86.99 
 
 
1460 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.751599  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0050  16S ribosomal RNA  86.99 
 
 
1460 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0063  16S ribosomal RNA  86.99 
 
 
1460 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0002  16S ribosomal RNA  86.99 
 
 
1460 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172959  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4347  16S ribosomal RNA  86.99 
 
 
1466 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0586197  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4352  16S ribosomal RNA  86.99 
 
 
1466 bp  533  1e-149  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0043  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 
1456 bp  527  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740548  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0043  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1475 bp  527  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0033  16S ribosomal RNA  84.44 
 
 
1475 bp  527  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0002  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 
1456 bp  527  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r1  16S ribosomal RNA  86.2 
 
 
1475 bp  527  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00986669  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0031  16S ribosomal RNA  84.82 
 
 
1499 bp  523  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0040  16S ribosomal RNA  84.82 
 
 
1499 bp  523  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.509918  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0018  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1489 bp  525  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0369143  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0065  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1489 bp  525  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.470185  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0013  16S ribosomal RNA  84.58 
 
 
1489 bp  525  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4294  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 
1464 bp  509  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0048  16S ribosomal RNA  84.1 
 
 
1484 bp  511  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0086  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 
1455 bp  504  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306946  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0059  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 
1455 bp  504  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.831402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0063  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 
1455 bp  504  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0071  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 
1455 bp  504  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0002  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 
1455 bp  504  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0087575  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0056  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 
1482 bp  494  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0049  16S ribosomal RNA  84.03 
 
 
1482 bp  494  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6006  16SrRNA  86.1 
 
 
1462 bp  494  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.504592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6013  16SrRNA  86.1 
 
 
1462 bp  494  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  82.45 
 
 
1471 bp  488  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  82.34 
 
 
1471 bp  480  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 
1497 bp  442  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 
1496 bp  442  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  84.83 
 
 
1497 bp  442  1e-121  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0008  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 
1479 bp  420  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0005  16S ribosomal RNA  85.11 
 
 
1479 bp  420  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258627  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  82.45 
 
 
1522 bp  412  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r16  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r10  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r19  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r13  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r04  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r26  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r22  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3021  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1518 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2998  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1517 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  82.31 
 
 
1522 bp  404  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>