More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0973 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  Wp16SA  16S ribosomal RNA  85.98 
 
 		 1447 bp  1084    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0013  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1485 bp  1088    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0973  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1498 bp  2970    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.628472  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0919  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1509 bp  1152    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r03  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1491 bp  609  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.048775  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r06  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1491 bp  609  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.083169  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr03  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1454 bp  609  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0018  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1476 bp  609  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0054  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1476 bp  609  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7267  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0072  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1476 bp  609  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0010  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1476 bp  609  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1586  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1454 bp  609  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1794  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1454 bp  609  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00503933  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1022  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1454 bp  609  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0049  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 1469 bp  599  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0042  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 1474 bp  599  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.087372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0051  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 1474 bp  599  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0056  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 1474 bp  599  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0054  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 1469 bp  599  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.859756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0040  16S ribosomal RNA  85.31 
 
 		 1469 bp  599  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0044  16S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 1459 bp  599  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0054  16S ribosomal RNA  85.41 
 
 		 1459 bp  599  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0021  16S ribosomal RNA  84.87 
 
 		 1479 bp  577  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0054  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1478 bp  567  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0050  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1478 bp  567  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0041  16S ribosomal RNA  84.35 
 
 		 1478 bp  567  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1086  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1472 bp  565  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0258  16S ribosomal RNA  84.75 
 
 		 1472 bp  565  1e-158  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0055  16S ribosomal RNA  84.51 
 
 		 1466 bp  547  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0031  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1499 bp  543  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0040  16S ribosomal RNA  87.1 
 
 		 1499 bp  543  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.509918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0012  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1475 bp  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0131794 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0070  16S ribosomal RNA  84.38 
 
 		 1475 bp  539  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0015  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1486 bp  511  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.857028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0064  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1486 bp  511  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00897748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r1  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1475 bp  511  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00986669  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0029  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1486 bp  511  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0035  16S ribosomal RNA  83.88 
 
 		 1486 bp  511  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0043  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1456 bp  511  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740548  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0002  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1456 bp  511  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0048  16S ribosomal RNA  86.4 
 
 		 1484 bp  511  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1477 bp  502  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1477 bp  502  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1477 bp  502  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  83.44 
 
 		 1477 bp  502  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0063  16S ribosomal RNA  85.89 
 
 		 1460 bp  490  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.29045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0055  16S ribosomal RNA  85.89 
 
 		 1460 bp  490  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0048  16S ribosomal RNA  85.89 
 
 		 1460 bp  490  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.211125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0036  16S ribosomal RNA  85.89 
 
 		 1460 bp  490  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.708988  normal  0.0771921 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0063  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1480 bp  484  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0005  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1480 bp  484  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0053  16S ribosomal RNA  83.33 
 
 		 1480 bp  484  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0063  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1460 bp  482  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4347  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1466 bp  482  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0586197  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4352  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1466 bp  482  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0050  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1460 bp  482  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0057  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1460 bp  482  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.751599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0002  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1460 bp  482  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0053  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1479 bp  456  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0059  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1479 bp  456  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0065  16S ribosomal RNA  85.16 
 
 		 1479 bp  456  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0017  16S ribosomal RNA  91.72 
 
 		 1460 bp  448  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.959999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0043  16S ribosomal RNA  91.72 
 
 		 1460 bp  448  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4294  16S ribosomal RNA  85.19 
 
 		 1464 bp  442  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11503  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0051  16S ribosomal RNA  91.12 
 
 		 1476 bp  432  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179513  normal  0.139607 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0073  16S ribosomal RNA  91.12 
 
 		 1476 bp  432  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0620583  hitchhiker  0.00094865 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0076  16S ribosomal RNA  91.12 
 
 		 1476 bp  432  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0029  16S ribosomal RNA  91.12 
 
 		 1476 bp  432  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.392184  hitchhiker  0.00162521 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0013  16S ribosomal RNA  91.12 
 
 		 1476 bp  432  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0044  16S ribosomal RNA  91.12 
 
 		 1476 bp  432  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.418237  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0018  16S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 1489 bp  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0369143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0065  16S ribosomal RNA  91.45 
 
 		 1489 bp  426  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.470185  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0013  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1489 bp  428  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA16S2  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1493 bp  428  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_rRNA16S1  16S ribosomal RNA  90.38 
 
 		 1493 bp  428  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  91.24 
 
 		 1496 bp  426  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  91.24 
 
 		 1497 bp  426  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  91.24 
 
 		 1497 bp  426  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0029  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1473 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.856058  normal  0.936634 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0036  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1473 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0013  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.90149  normal  0.275981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0029  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.952441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0042  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0036  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.61478  normal  0.377738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0021  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0028  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0034  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.642748  normal  0.622326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0042  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0013  16S ribosomal RNA  90.11 
 
 		 1490 bp  420  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0023  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1473 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.315031  normal  0.748823 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0013  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.15645 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0022  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1478 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0044  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1473 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.42631 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0015  16S ribosomal RNA  90.99 
 
 		 1473 bp  422  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.551899 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0049  16S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 1482 bp  418  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0056  16S ribosomal RNA  91.15 
 
 		 1482 bp  418  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0043  16S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 1475 bp  418  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0033  16S ribosomal RNA  88.92 
 
 		 1475 bp  418  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6501  16S ribosomal RNA  86.23 
 
 		 1485 bp  414  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4504  16S ribosomal RNA  86.23 
 
 		 1485 bp  414  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>