More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0919 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  Wp16SA  16S ribosomal RNA  88.86 
 
 		 1447 bp  1417    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0054  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1478 bp  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0041  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1478 bp  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.108984 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0017  16S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 1460 bp  702    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.959999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0050  16S ribosomal RNA  85.71 
 
 		 1478 bp  646    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.487076 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0013  16S ribosomal RNA  98.25 
 
 		 1485 bp  2724    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0043  16S ribosomal RNA  86.76 
 
 		 1460 bp  702    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0973  16S ribosomal RNA  85.75 
 
 		 1498 bp  1152    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.628472  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0919  16S ribosomal RNA  100 
 
 		 1509 bp  2991    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0021  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 1479 bp  628  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.705337 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0072  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.525024  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0010  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0054  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7267  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0018  16S ribosomal RNA  86.33 
 
 		 1476 bp  626  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0044  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 		 1459 bp  622  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0054  16S ribosomal RNA  85.33 
 
 		 1459 bp  622  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1086  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 		 1472 bp  617  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0258  16S ribosomal RNA  85.83 
 
 		 1472 bp  617  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0004  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 1477 bp  617  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0018  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 1477 bp  617  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0046  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 1477 bp  617  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0064  16S ribosomal RNA  85.34 
 
 		 1477 bp  617  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1022  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 1454 bp  605  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r03  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 1491 bp  605  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.048775  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_r06  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 1491 bp  605  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.083169  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAr03  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 1454 bp  605  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1586  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 1454 bp  605  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1794  16S ribosomal RNA  85.77 
 
 		 1454 bp  605  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00503933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0018  16S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 1478 bp  597  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0006  16S ribosomal RNA  84.93 
 
 		 1478 bp  597  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.439263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0051  16S ribosomal RNA  85.56 
 
 		 1461 bp  589  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0042  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1474 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.087372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0054  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1469 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.859756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0051  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1474 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0056  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1474 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.347573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0049  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1469 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0040  16S ribosomal RNA  85.58 
 
 		 1469 bp  587  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0064  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1486 bp  585  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00897748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0029  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1486 bp  585  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0035  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1486 bp  585  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0015  16S ribosomal RNA  85.38 
 
 		 1486 bp  585  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.857028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0005  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1480 bp  581  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0053  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1480 bp  581  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0063  16S ribosomal RNA  85.26 
 
 		 1480 bp  581  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4501  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1485 bp  561  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.60062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4504  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1485 bp  561  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6501  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1485 bp  561  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6504  16S ribosomal RNA  84.41 
 
 		 1485 bp  561  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0055  16S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 1460 bp  547  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0048  16S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 1460 bp  547  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.211125 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_R0063  16S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 1460 bp  547  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.29045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0036  16S ribosomal RNA  86.5 
 
 		 1460 bp  547  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.708988  normal  0.0771921 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0057  16S ribosomal RNA  83.08 
 
 		 1471 bp  541  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000162206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0033  16S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 1475 bp  541  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0043  16S ribosomal RNA  84.56 
 
 		 1475 bp  541  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0040  16S ribosomal RNA  84.94 
 
 		 1499 bp  537  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.509918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0031  16S ribosomal RNA  84.94 
 
 		 1499 bp  537  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0052  16S ribosomal RNA  82.97 
 
 		 1471 bp  533  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0176979  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0050  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1460 bp  525  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0057  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1460 bp  525  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.751599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0002  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1460 bp  525  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0063  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1460 bp  525  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4347  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1466 bp  525  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0586197  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4352  16S ribosomal RNA  86.81 
 
 		 1466 bp  525  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0018  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 1489 bp  523  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0369143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0065  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 1489 bp  523  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.470185  normal  0.0920811 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0013  16S ribosomal RNA  84.42 
 
 		 1489 bp  523  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_r1  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 1475 bp  521  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00986669  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0043  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 1456 bp  521  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.740548  normal  0.401653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0002  16S ribosomal RNA  85.69 
 
 		 1456 bp  521  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0021  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1487 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.779326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0029  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1475 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560965  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0051  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1475 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0070  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1487 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.560965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0033  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1487 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0059  16S ribosomal RNA  84.14 
 
 		 1475 bp  517  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.66406  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0048  16S ribosomal RNA  84.08 
 
 		 1484 bp  517  1e-144  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.285234 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4294  16S ribosomal RNA  87.23 
 
 		 1464 bp  502  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11503  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0086  16S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 1455 bp  500  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.306946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0059  16S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 1455 bp  500  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.831402 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0063  16S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 1455 bp  500  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0071  16S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 1455 bp  500  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.129895 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0002  16S ribosomal RNA  85.5 
 
 		 1455 bp  500  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0087575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6006  16SrRNA  85.92 
 
 		 1462 bp  486  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.504592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6013  16SrRNA  85.92 
 
 		 1462 bp  486  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0003  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1496 bp  434  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0041999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0038  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1497 bp  434  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0565772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0042  16S ribosomal RNA  84.66 
 
 		 1497 bp  434  1e-119  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000393609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3010  16S ribosomal RNA  82.57 
 
 		 1522 bp  426  1e-117  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0071  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1523 bp  422  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.121769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0092  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1523 bp  422  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00736494  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0089  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1523 bp  422  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00770001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0002  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1523 bp  422  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272962  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0086  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1523 bp  422  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0165125  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0066  16S ribosomal RNA  82.78 
 
 		 1523 bp  422  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.043878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3018  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1518 bp  418  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_r01  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1522 bp  418  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3001  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1517 bp  418  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3004  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1522 bp  418  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_3007  16S ribosomal RNA  82.43 
 
 		 1522 bp  418  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>