239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2912 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2912  LemA family protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000943638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4034  LemA family protein  95.12 
 
 		 164 aa  302  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000186769  normal  0.738448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  53.89 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  53.33 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  52.78 
 
 		 202 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  49.48 
 
 		 197 aa  204  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  49.22 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  49.22 
 
 		 207 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2519  LemA family protein  51.02 
 
 		 212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  47.42 
 
 		 212 aa  197  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4544  LemA family protein  48.69 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.171752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  48.7 
 
 		 220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0425  LemA family protein  47.18 
 
 		 195 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  48.5 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0607  LemA family protein  51.37 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  46.97 
 
 		 203 aa  192  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0555  LemA family protein  51.37 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.556411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1511  LemA family protein  53.04 
 
 		 204 aa  192  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.69896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  47.98 
 
 		 203 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  46.23 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0316  LemA family protein  46.04 
 
 		 201 aa  191  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.529151 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0311  LemA family protein  46.04 
 
 		 201 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.206877  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  50.56 
 
 		 220 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  49.2 
 
 		 197 aa  191  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  49.17 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0598  LemA family protein  49.2 
 
 		 203 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  47.45 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  48.72 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  51.38 
 
 		 222 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0331  hypothetical protein  48.65 
 
 		 201 aa  187  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1074  LemA family protein  47.74 
 
 		 204 aa  186  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  49.44 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  45.96 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2694  LemA family protein  50.54 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  46.43 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0381  LemA family protein  47.83 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  50.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  50.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  50.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  50.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  50.28 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  50.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  50.28 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4853  LemA family protein  47.8 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  48.9 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  48.9 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  45.13 
 
 		 210 aa  184  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  45.88 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0102  hypothetical protein  46.2 
 
 		 210 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.95764  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  48.47 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0145  LemA protein  49.19 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551887  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0664  lipoprotein  51.37 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.742041 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3226  hypothetical protein  47.18 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.969393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2276  hypothetical protein  46.67 
 
 		 194 aa  169  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.23375e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1229  LemA family protein  45.36 
 
 		 215 aa  167  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0161129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0259  LemA family protein  44.44 
 
 		 199 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.954507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0896  LemA family protein  44.55 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.652606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  43.65 
 
 		 198 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  48.8 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  41.75 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  42.86 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0393  LemA family protein  45.18 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.329178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1298  hypothetical protein  47.49 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0324719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  40.31 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  38.5 
 
 		 212 aa  157  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  42.63 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0879  hypothetical protein  43.28 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2423  LemA family protein  46.2 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903049  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  45.56 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3454  LemA family protein  44.04 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23113  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0991  hypothetical protein  43 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.658235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  41.33 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1081  LemA family protein  41 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.88944  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0413  LemA family protein  43.88 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  40.76 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  44.02 
 
 		 194 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0924  LemA family protein  42.7 
 
 		 193 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.278173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0912  LemA family protein  42.46 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47030  Conserved hypothetical protein, LemA family  46.88 
 
 		 204 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  43.3 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  44.63 
 
 		 194 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0916  LemA family protein  42.46 
 
 		 193 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.440516  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1669  LemA family protein  43.24 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.39054  normal  0.0232057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0811  hypothetical protein  43.3 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1822  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1754  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  149  3e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  40 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  40.82 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2022  LemA family protein  45.36 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000112346  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  46.3 
 
 		 197 aa  147  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  41.4 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  43.55 
 
 		 246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  43.48 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  44.2 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  41.9 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  44.2 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  41.24 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  42.33 
 
 		 185 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  42.11 
 
 		 193 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0867  hypothetical protein  41.14 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>