165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0288 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  316  7e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  95.33 
 
 
150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  92.67 
 
 
150 aa  293  7e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  92.67 
 
 
150 aa  293  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  92.67 
 
 
150 aa  293  7e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  92 
 
 
150 aa  292  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  92 
 
 
150 aa  292  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  95.16 
 
 
124 aa  250  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  43.51 
 
 
158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  35.81 
 
 
150 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  38.12 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
167 aa  94.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  40.82 
 
 
174 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
154 aa  92  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  35.81 
 
 
169 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
159 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  34.64 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  35.57 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  35.81 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  33.78 
 
 
159 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  34.23 
 
 
164 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
177 aa  84.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  32.89 
 
 
166 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  35.33 
 
 
176 aa  83.6  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
174 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  36.3 
 
 
174 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  32.86 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
166 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  33.11 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  32.21 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  32 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  30.13 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  32.69 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 
167 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  32.89 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  32.03 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  36.24 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  28.38 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  33.86 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  33.12 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
180 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  30.07 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6333  acetyltransferase  27.41 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0488067  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  30.67 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  31.54 
 
 
164 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  34.35 
 
 
166 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
184 aa  60.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 
170 aa  60.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
149 aa  60.8  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
153 aa  60.8  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
160 aa  60.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2640  acetyltransferase  27.78 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
176 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2146  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.9961  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3670  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
170 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
203 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2073  acetyltransferase  30.41 
 
 
171 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.539818 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
184 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  29.14 
 
 
156 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  25.68 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 
173 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  27.21 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  26.8 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  30.52 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2760  GCN5-related N-acetyltransferase  32.61 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.646196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
181 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6096  hypothetical protein  28.24 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.164941  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  26.83 
 
 
173 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1981  hypothetical protein  28.24 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  25.77 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  27.01 
 
 
164 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1583  GCN5-related N-acetyltransferase  30.07 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.241849 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0750  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 
150 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620129  normal  0.699411 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01471  hypothetical protein  32.89 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  26.9 
 
 
203 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  27.17 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1581  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579775  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0298  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
141 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  26.83 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  26.83 
 
 
173 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  29.56 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  27.69 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0137231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1398  GCN5-related N-acetyltransferase  28.77 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1883  acetyltransferase  28.91 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000184647 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>