104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1489 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
166 aa  335  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  86.14 
 
 
166 aa  292  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  74.1 
 
 
166 aa  245  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  69.23 
 
 
166 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  70.32 
 
 
169 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  69.93 
 
 
169 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  70.51 
 
 
166 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  61.15 
 
 
167 aa  185  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  56.05 
 
 
167 aa  164  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  59.35 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.18 
 
 
173 aa  92.4  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  34.67 
 
 
158 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
162 aa  90.5  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  33.56 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  33.56 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  33.78 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  33.14 
 
 
320 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  33.11 
 
 
150 aa  74.3  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
174 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  33.77 
 
 
155 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  37.41 
 
 
176 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  32.24 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  34.01 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  34.69 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  35.43 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  29.41 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  25.16 
 
 
159 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  31.94 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  23.87 
 
 
159 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  24.52 
 
 
159 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  28.67 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  29.87 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  26.8 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  24.5 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  28.76 
 
 
157 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2290  hypothetical protein  31.01 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  29.25 
 
 
174 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2661  acetyltransferase  31.65 
 
 
155 aa  58.2  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.037655  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  23.68 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  57.4  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10731  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  35.4 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  25.33 
 
 
203 aa  54.3  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  26.77 
 
 
128 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29921  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 
161 aa  54.3  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.777494 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  28.26 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  25.87 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  27.07 
 
 
173 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
169 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
169 aa  51.2  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
151 aa  50.8  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  24.48 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0651  acetyltransferase  28.35 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  28.15 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4454  GNAT family acetyltransferase  28.17 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  27.07 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
177 aa  48.1  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51560  acetyltransferase  27.56 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.44093e-17  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3109  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
149 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0976115  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  25.83 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
173 aa  45.1  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1302  acetyltransferase  24.5 
 
 
162 aa  44.7  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.949443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2042  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313561  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1225  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0331323 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.833574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4578  putative GCN5-related N-acetyltransferase (GNAT)  34.41 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140894  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0109  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
202 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07991  GCN5-related N-acetyltransferase  25.49 
 
 
171 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170706  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0199  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
176 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.228085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  33.87 
 
 
146 aa  42  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
164 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
181 aa  41.2  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1139  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.71 
 
 
155 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>