163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3557 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
154 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  54.43 
 
 
158 aa  193  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  53.95 
 
 
155 aa  186  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  54.61 
 
 
159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  50.65 
 
 
154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  47.71 
 
 
155 aa  169  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  42.38 
 
 
156 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  42 
 
 
158 aa  124  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  40 
 
 
159 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  39.87 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  41.45 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  38.67 
 
 
159 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  37.33 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
163 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  39.61 
 
 
155 aa  111  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  38.93 
 
 
162 aa  107  5e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  36.84 
 
 
150 aa  99  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  38.52 
 
 
128 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 
161 aa  97.1  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  37.58 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  37.58 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
174 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  37.33 
 
 
150 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  35.42 
 
 
173 aa  90.1  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  31.13 
 
 
156 aa  87.4  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  38.21 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  31.58 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 
169 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  30 
 
 
164 aa  72.8  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
177 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.33 
 
 
166 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  28.99 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  27.17 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  26.71 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  28.93 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  37.9 
 
 
184 aa  67  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
166 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
170 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  33.08 
 
 
160 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
203 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  27.63 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  24.53 
 
 
169 aa  62.4  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  23.9 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  23.9 
 
 
169 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  23.46 
 
 
173 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
174 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  27.06 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  27.59 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  27.59 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  20.92 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  27.59 
 
 
176 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  26.47 
 
 
174 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  28.79 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  28.46 
 
 
151 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  20.26 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
177 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0651  acetyltransferase  27.81 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1302  acetyltransferase  21.19 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.949443  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51560  acetyltransferase  25.95 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.44093e-17  hitchhiker  0.0000412159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3561  GCN5-related N-acetyltransferase  26 
 
 
174 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  23.97 
 
 
173 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  26.9 
 
 
176 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  23.33 
 
 
203 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  28.79 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
298 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  28.46 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.291199 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  34.85 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  24.54 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  23.29 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 
181 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4220  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
177 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2290  hypothetical protein  23.18 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2661  acetyltransferase  22.88 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.037655  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01471  hypothetical protein  30.38 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  35.38 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  35.38 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  31.25 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10731  GCN5-related N-acetyltransferase  19.35 
 
 
158 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
142 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>