83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1425 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 181 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  61.18 
 
 		 170 aa  223  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  55.28 
 
 		 166 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  50.59 
 
 		 203 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  50.3 
 
 		 173 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  50.91 
 
 		 169 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  50 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  50.61 
 
 		 173 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  50.3 
 
 		 169 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  49.39 
 
 		 173 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  48.5 
 
 		 203 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  46.78 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  45.68 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  40.56 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  35.37 
 
 		 320 aa  89  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  27.52 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  29.35 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 		 163 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  29.87 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  28.39 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  27.5 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  30.25 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  31.58 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  30.49 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  26.17 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  23.65 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  25.83 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  30.12 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 174 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  27.92 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 		 159 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  25.29 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  28.76 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  25.5 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  28.37 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  30 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  29.08 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  28.37 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  30.06 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  30.06 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  30.06 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 		 124 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  31.41 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 154 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  27.21 
 
 		 150 aa  51.2  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  29.65 
 
 		 150 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  30.06 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  30.06 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  29.07 
 
 		 150 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  24.58 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  27.21 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  25.44 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  25 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 		 154 aa  45.8  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  22.36 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  24.06 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3185  streptothricin acetyltransferase  28 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.95857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3192  putative streptothricin acetyltransferase  28 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2961  streptothricin acetyltransferase  28 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  25.3 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1644  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.796176  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10731  GCN5-related N-acetyltransferase  25.78 
 
 		 158 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 159 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  27 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1302  acetyltransferase  27.16 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.949443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  24.19 
 
 		 128 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  25.95 
 
 		 152 aa  40.8  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  35.38 
 
 		 150 aa  40.8  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>