105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05473 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  100 
 
 		 155 aa  317  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  50 
 
 		 156 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  51.3 
 
 		 156 aa  155  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  44.16 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  43.42 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  42.86 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 		 154 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  36.77 
 
 		 164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  36.08 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  37.01 
 
 		 173 aa  100  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  35.76 
 
 		 166 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  34.87 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  36.36 
 
 		 164 aa  92.8  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  33.77 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 166 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  35.57 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  36.24 
 
 		 150 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 		 166 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 161 aa  84  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  40.91 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  30.46 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  35.57 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  33.76 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  27.15 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  27.33 
 
 		 159 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  33.12 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  26.67 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  34.68 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  28.1 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  30.2 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  27.61 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  29.53 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  29.53 
 
 		 176 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  27.61 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  27.52 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 167 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  26.83 
 
 		 173 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 		 174 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  32.37 
 
 		 178 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  27.87 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  25 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  27.89 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  27.15 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  25.31 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  26.53 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  18.83 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 169 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 		 170 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  31.82 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  24.69 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  18.83 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  18.83 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  28.19 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  26.01 
 
 		 180 aa  54.3  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  26.12 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1888  acetyltransferase  28.05 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.789075  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  22.42 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  27.22 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2661  acetyltransferase  23.18 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.037655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  29.19 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1302  acetyltransferase  21.19 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.949443  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  29.55 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0535  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 142 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  28.03 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  34.62 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10731  GCN5-related N-acetyltransferase  20.93 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  31.62 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0582  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0137231 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2290  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1850  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000283467  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  29.89 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 150 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7229  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 		 184 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.291199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>