126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1109 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
177 aa  370  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
203 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  51.23 
 
 
169 aa  170  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  51.23 
 
 
169 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  47.4 
 
 
173 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  50.62 
 
 
173 aa  167  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  47.93 
 
 
173 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  47.34 
 
 
173 aa  164  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  48.15 
 
 
203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  48.15 
 
 
170 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
166 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  44.51 
 
 
166 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  45.68 
 
 
181 aa  142  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  45.51 
 
 
185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  36.18 
 
 
320 aa  96.7  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  29.52 
 
 
164 aa  87.4  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 
180 aa  85.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
164 aa  84  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  31.43 
 
 
176 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  31.43 
 
 
177 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  38.28 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  29.29 
 
 
176 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  29.29 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  29.29 
 
 
176 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
158 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  28.76 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  27.97 
 
 
159 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  32.69 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  32.69 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  32.69 
 
 
150 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
154 aa  72  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  29.14 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  33.33 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  26.8 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  30.13 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  29.51 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
161 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  28.57 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  27.7 
 
 
160 aa  62  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  28.26 
 
 
155 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 
155 aa  61.2  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  28 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  28.23 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
169 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
154 aa  58.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  25.35 
 
 
166 aa  58.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  24.67 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  20.65 
 
 
159 aa  55.5  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  26.39 
 
 
166 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  25.5 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
166 aa  52  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  24.32 
 
 
150 aa  52.4  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  26.17 
 
 
164 aa  50.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  23.58 
 
 
128 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0127  hypothetical protein  26.92 
 
 
391 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1387  hypothetical protein  29.11 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00528266  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
150 aa  48.9  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1489  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 
166 aa  48.1  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.170228  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1033  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
162 aa  47.8  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  23.24 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3551  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 
129 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5655  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0802774  normal  0.262876 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2748  acetyltransferase  30.95 
 
 
152 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.668907  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  24.39 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  24.39 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
164 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0291  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 
307 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  22.54 
 
 
173 aa  45.1  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2696  GCN5-related N-acetyltransferase  23.02 
 
 
156 aa  45.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000270172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1433  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
153 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3203  putative streptothricin acetyltransferase  25.53 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3197  streptothricin acetyltransferase, putative  25.53 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288156  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0214  hypothetical protein  26.09 
 
 
171 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  27.16 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2119  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175138  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0940  GCN5-related N-acetyltransferase  32.26 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1443  hypothetical protein  27.55 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  21.68 
 
 
157 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0771  putative acetyltransferase  29.03 
 
 
294 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.295128 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2162  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  27.68 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5516  GCN5-related N-acetyltransferase  25.45 
 
 
300 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0715522  normal  0.230819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0423  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
266 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3357  GCN5-related N-acetyltransferase  36.07 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.784211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1950  GCN5-related N-acetyltransferase  44.68 
 
 
160 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>