119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1538 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1538  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
170 aa  355  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1425  GCN5-related N-acetyltransferase  61.18 
 
 
181 aa  223  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.167968 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1284  GCN5-related N-acetyltransferase  55.21 
 
 
166 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.568121 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1298  GCN5-related N-acetyltransferase  58.79 
 
 
166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3158  GCN5-related N-acetyltransferase  48.78 
 
 
203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1363  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
169 aa  164  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.933433  hitchhiker  0.000190742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3015  GCN5-related N-acetyltransferase  49.39 
 
 
169 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  48.78 
 
 
173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1219  acetyltransferase  46.95 
 
 
173 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.846102 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3324  acetyltransferase  46.11 
 
 
203 aa  153  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2666  GCN5-related N-acetyltransferase  48.12 
 
 
170 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0312822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1289  acetyltransferase  44.91 
 
 
173 aa  152  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.057634  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1218  acetyltransferase  45.73 
 
 
173 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.148458  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1109  GCN5-related N-acetyltransferase  46.3 
 
 
177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1251  GCN5-related N-acetyltransferase  37.02 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1299  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 
180 aa  91.3  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2371  hypothetical protein  29.88 
 
 
320 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.896111  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  27.04 
 
 
164 aa  77.8  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2759  acetyltransferase  30.12 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3474  acetyltransferase  28.86 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000407854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3757  acetyltransferase  29.33 
 
 
159 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162031  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0963  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 
160 aa  72.4  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1060  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3828  acetyltransferase, gnat family  27.67 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00017711  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3495  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000137557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1357  GCN5-related N-acetyltransferase  25.93 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3557  GCN5-related N-acetyltransferase  25.61 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0960  GCN5-related N-acetyltransferase  27.03 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3157  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1364  GCN5-related N-acetyltransferase  30.65 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139138 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00229  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  29.49 
 
 
150 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00232  hypothetical protein  29.49 
 
 
150 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3514  acetyltransferase  26.62 
 
 
156 aa  61.6  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.191622 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3014  GCN5-related N-acetyltransferase  29.84 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  23.64 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3373  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0451  acetyltransferase  23.68 
 
 
156 aa  60.5  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.896782  normal  0.723991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0279  hypothetical protein  29.49 
 
 
150 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0261  hypothetical protein  27.56 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0266  hypothetical protein  27.56 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0969  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
156 aa  58.2  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0229  hypothetical protein  27.56 
 
 
150 aa  58.2  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1290  acetyltransferase  24.54 
 
 
176 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0542587  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1219  acetyltransferase  24.54 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0886873  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0288  hypothetical protein  28.48 
 
 
150 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.867365  normal  0.217589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1220  acetyltransferase  23.93 
 
 
176 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.850535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  27.15 
 
 
166 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  26.42 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3323  acetyltransferase  24.82 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003587  acetyltransferase GNAT family  24.07 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  21.21 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1831  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0803543  normal  0.0847083 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1473  acetyltransferase  25.56 
 
 
128 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000250439  hitchhiker  0.00000579727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2718  acetyltransferase  23.57 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1001  acetyltransferase  26.12 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.219128  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0887  acetyltransferase  27.03 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  unclonable  0.000000133756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2068  GCN5-related N-acetyltransferase  26.17 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.313385  normal  0.750925 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2665  GCN5-related N-acetyltransferase  22.92 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0357871  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414062  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  25.37 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545017  normal  0.907413 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3372  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
169 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0040  acetyltransferase  25.3 
 
 
150 aa  51.2  0.000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10761  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
156 aa  51.2  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.397538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  25.97 
 
 
166 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05473  putative acyltransferase protein  23.64 
 
 
155 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0190305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02546  hypothetical protein  18.79 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3685  GCN5-related N-acetyltransferase  23.84 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0136  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  36.49 
 
 
159 aa  48.1  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  45.83 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1562  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.233246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2088  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1230  GCN5-related N-acetyltransferase  23.84 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814852  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3209  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
184 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2811  acetyltransferase  24.24 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  27.1 
 
 
152 aa  45.4  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3070  acetyltransferase, GNAT family  33.33 
 
 
151 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  24.26 
 
 
160 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  22.63 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2799  GCN5-related N-acetyltransferase  23.03 
 
 
154 aa  44.3  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1727  acetyltransferase  34.48 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1863  acetyltransferase  34.48 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.750595  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0781  GCN5-related N-acetyltransferase  27.35 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  34.72 
 
 
164 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3976  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1705  acetyltransferase  31.43 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1679  acetyltransferase  30.14 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00221151  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2109  hypothetical protein  33.33 
 
 
336 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1659  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3374  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0078715  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1901  acetyltransferase, GNAT family  30.14 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3185  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.082232  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0057  GCN5-related N-acetyltransferase  31.94 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  39.68 
 
 
364 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 
161 aa  42.7  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1864  acetyltransferase, GNAT family  28.92 
 
 
147 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>